Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C1DQ13901 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C1DQ13901 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C1DQ13901 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1DQ13901 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C1DQ13901 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C1DQ13901 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms