Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PMS2P11Q13670 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PMS2P11Q13670 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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