Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL1Q13616 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL1Q13616 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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