Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTMR1Q13613 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTMR1Q13613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
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