Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PEX6Q13608 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX6Q13608 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX6Q13608 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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