Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BFSP2Q13515 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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