Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSAMPQ13449 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSAMPQ13449 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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