Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD1Q13393 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLD1Q13393 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD1Q13393 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms