Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SKP2Q13309 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SKP2Q13309 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SKP2Q13309 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SKP2Q13309 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SKP2Q13309 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SKP2Q13309 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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