Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3FQ13275 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3FQ13275 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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