Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR1H3Q13133 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR1H3Q13133 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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