Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAF1BQ13112 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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