Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECH1Q13011 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECH1Q13011 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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