Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BNIP3Q12983 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BNIP3Q12983 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms