Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRJQ12913 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRJQ12913 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms