Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN2Q12907 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN2Q12907 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms