Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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RAB40BQ12829 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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RAB40BQ12829 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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RAB40BQ12829 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RAB40BQ12829 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB40BQ12829 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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