Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNH2Q12809 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNH2Q12809 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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