Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCRN1Q12765 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCRN1Q12765 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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