Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 RET3YPL010W 570 nt3.45□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 DSS4YPR017C 432 nt3.45□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 PMT6YGR199W 2280 nt3.45□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YOL075CYOL075C 3885 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 RSC58YLR033W 1509 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 NGL3YML118W 1518 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 SSM4YIL030C 3960 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 ADK2YER170W 678 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 ECM34YHL043W 513 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YJR037WYJR037W 384 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 MED7YOL135C 669 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 RDL1YOR285W 420 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YMR018WYMR018W 1545 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YPR022CYPR022C 3402 nt3.44□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YGL152CYGL152C 678 nt3.43□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 CUS2YNL286W 858 nt3.43□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 IDH2YOR136W 1110 nt3.43□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 PRP19YLL036C 1512 nt3.43□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 RTT109YLL002W 1311 nt3.43□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 FCF1YDR339C 570 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 ARG80YMR042W 534 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YPL088WYPL088W 1029 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 TAF1YGR274C 3201 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 BAR1YIL015W 1764 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 SEA4YBL104C 3117 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 TYW1YPL207W 2433 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 STE12YHR084W 2067 nt3.42□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 ECO1YFR027W 846 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YKE4YIL023C 1041 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YKL169CYKL169C 384 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YBL036CYBL036C 774 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 YNR061CYNR061C 660 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 SUC2YIL162W 1599 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 APN2YBL019W 1563 nt3.41□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 SYT1YPR095C 3681 nt3.4□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 BMS1YPL217C 3552 nt3.4□□□□□ -1.86
RTR2Q12378 CPR1YDR155C 489 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 IRC22YEL001C 678 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 BMH1YER177W 804 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 CAF16YFL028C 870 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YGL199CYGL199C 471 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YJR096WYJR096W 849 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SHH3YMR118C 591 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 GLO4YOR040W 858 nt3.4□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 URA2YJL130C 6645 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 EXO70YJL085W 1872 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 CWC2YDL209C 1020 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 STE14YDR410C 720 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 MRP13YGR084C 1020 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YKT6YKL196C 603 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 TVP18YMR071C 504 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YPL114WYPL114W 420 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 TSR1YDL060W 2367 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 PTR3YFR029W 2037 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 ALR2YFL050C 2577 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 KAP95YLR347C 2586 nt3.39□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 NAM2YLR382C 2685 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SMC3YJL074C 3693 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 BUD27YFL023W 2391 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YIL028WYIL028W 399 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YIL152WYIL152W 708 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 AUR1YKL004W 1206 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SLD7YOR060C 774 nt3.38□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SEC2YNL272C 2280 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YLR177WYLR177W 1887 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 LDB17YDL146W 1476 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 MEK1YOR351C 1494 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 QRI7YDL104C 1224 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 AHA1YDR214W 1053 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 PER33YLR064W 822 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 EOS1YNL080C 1101 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 PFA4YOL003C 1137 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 ZDS2YML109W 2829 nt3.37□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 ARH1YDR376W 1482 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YCR085WYCR085W 354 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 MAF1YDR005C 1188 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YGR051CYGR051C 324 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 KRE9YJL174W 831 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 RSF1YMR030W 1131 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 CBP1YJL209W 1965 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 AIM21YIR003W 2040 nt3.36□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 FAP7YDL166C 594 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 RCR2YDR003W 633 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SNF11YDR073W 510 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.35□□□□□ -1.87
RTR2Q12378 YGR079WYGR079W 1113 nt3.35□□□□□ -1.87
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