Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 TIP41YPR040W 1071 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 PWR1PWR1 941 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 PEP7YDR323C 1548 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 GEM1YAL048C 1989 nt3.47□□□□□ -1.85
USB1Q12208 IOC2YLR095C 2439 nt3.46□□□□□ -1.85
USB1Q12208 SPT16YGL207W 3108 nt3.46□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ROK1YGL171W 1695 nt3.46□□□□□ -1.85
USB1Q12208 ARX1YDR101C 1782 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 RIM4YHL024W 2142 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 NUS1YDL193W 1128 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 AIM7YDR063W 450 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 INO2YDR123C 915 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 TYS1YGR185C 1185 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 VMA22YHR060W 546 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 PIR3YKL163W 978 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 MRPL20YKR085C 588 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YOR131CYOR131C 657 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YPL073CYPL073C 486 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 NRG2YBR066C 663 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 MST1YKL194C 1389 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 TAF6YGL112C 1551 nt3.46□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ACE2YLR131C 2313 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 CWH43YCR017C 2862 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 DEG1YFL001W 1329 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 GPI18YBR004C 1302 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ALE1YOR175C 1860 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 HPR1YDR138W 2259 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 VHS3YOR054C 2025 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 DIN7YDR263C 1293 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 UBC8YEL012W 657 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 CAF16YFL028C 870 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 UTP11YKL099C 753 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YLR428CYLR428C 345 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ATG8YBL078C 354 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SLM5YCR024C 1479 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YBR225WYBR225W 2703 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SET4YJL105W 1683 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SEC2YNL272C 2280 nt3.45□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YLR345WYLR345W 1530 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 PTA1YAL043C 2358 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 MIH1YMR036C 1665 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ALG9YNL219C 1668 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 VAC17YCL063W 1272 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 PRP11YDL043C 801 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 TMA17YDL110C 453 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 BIO2YGR286C 1128 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ELF1YKL160W 438 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 PER33YLR064W 822 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YLR124WYLR124W 345 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ARG80YMR042W 534 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YNL143CYNL143C 393 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 RPL18BYNL301C 561 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 FSH3YOR280C 801 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SLX1YBR228W 915 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 AIM21YIR003W 2040 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 APL4YPR029C 2499 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YRB30YGL164C 1323 nt3.44□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YGR079WYGR079W 1113 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SPC42YKL042W 1092 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YMR114CYMR114C 1107 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 PHA2YNL316C 1005 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 DSC2YOL073C 969 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YPR059CYPR059C 387 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 NGL3YML118W 1518 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 GPI10YGL142C 1851 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 IOC4YMR044W 1428 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 RKM3YBR030W 1659 nt3.43□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ARO80YDR421W 2853 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 POL1YNL102W 4407 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YDL228CYDL228C 642 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 DPB4YDR121W 591 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 RSA3YLR221C 663 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YBL029WYBL029W 1131 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 EOS1YNL080C 1101 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ECM22YLR228C 2445 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 GPB1YOR371C 2694 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 DHR2YKL078W 2208 nt3.42□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YDR132CYDR132C 1488 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 NOP6YDL213C 678 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 HSP42YDR171W 1128 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 YGL199CYGL199C 471 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 SKI8YGL213C 1194 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 MRPL25YGR076C 474 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ADD66YKL206C 804 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 REX4YOL080C 870 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 POC4YPL144W 447 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 ARR1YPR199C 885 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 GDT1YBR187W 843 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 USA1YML029W 2517 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 TCB3YML072C 4638 nt3.41□□□□□ -1.86
USB1Q12208 GAS2YLR343W 1668 nt3.4□□□□□ -1.86
USB1Q12208 URC2YDR520C 2319 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 BUD16YEL029C 939 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SPC34YKR037C 888 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YNR061CYNR061C 660 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SNF8YPL002C 702 nt3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms