Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMAGPQ0VAQ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMAGPQ0VAQ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms