Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RASGEF1BQ0VAM2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RASGEF1BQ0VAM2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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