Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4DQ08499 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE4DQ08499 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms