Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SRSF4Q08170 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SRSF4Q08170 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SRSF4Q08170 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms