Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KDSRQ06136 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KDSRQ06136 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms