Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTK2Q05397 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms