Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN12Q05209 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN12Q05209 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms