Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLH1Q02575 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NHLH1Q02575 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NHLH1Q02575 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms