Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
XPCQ01831 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
XPCQ01831 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
XPCQ01831 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
XPCQ01831 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
XPCQ01831 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XPCQ01831 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XPCQ01831 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
XPCQ01831 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
XPCQ01831 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
XPCQ01831 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
XPCQ01831 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
XPCQ01831 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
XPCQ01831 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
XPCQ01831 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms