Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IFITM3Q01628 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IFITM3Q01628 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms