Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA4P83105 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTRA4P83105 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms