Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMF1P82094 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMF1P82094 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMF1P82094 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMF1P82094 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMF1P82094 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMF1P82094 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMF1P82094 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMF1P82094 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TMF1P82094 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMF1P82094 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMF1P82094 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
TMF1P82094 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMF1P82094 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMF1P82094 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMF1P82094 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMF1P82094 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMF1P82094 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMF1P82094 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMF1P82094 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMF1P82094 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMF1P82094 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TMF1P82094 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMF1P82094 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMF1P82094 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMF1P82094 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMF1P82094 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms