Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNA1P78396 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms