Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT83P78385 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT83P78385 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT83P78385 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT83P78385 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT83P78385 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT83P78385 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT83P78385 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT83P78385 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT83P78385 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT83P78385 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT83P78385 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT83P78385 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms