Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBB4BP68371 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB4BP68371 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms