Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RPS29P62273 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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