Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2D3P61077 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms