Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CABP4P57796 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CABP4P57796 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CABP4P57796 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CABP4P57796 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CABP4P57796 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CABP4P57796 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CABP4P57796 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CABP4P57796 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CABP4P57796 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CABP4P57796 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CABP4P57796 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms