Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RIPK4P57078 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RIPK4P57078 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RIPK4P57078 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms