Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTBP2P56545 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTBP2P56545 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms