Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S2P56377 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S2P56377 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms