Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC13P55735 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC13P55735 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC13P55735 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC13P55735 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC13P55735 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC13P55735 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC13P55735 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC13P55735 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC13P55735 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC13P55735 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms