Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFDNP55196 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFDNP55196 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFDNP55196 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AFDNP55196 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
AFDNP55196 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AFDNP55196 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AFDNP55196 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AFDNP55196 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AFDNP55196 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AFDNP55196 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AFDNP55196 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AFDNP55196 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFDNP55196 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFDNP55196 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFDNP55196 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFDNP55196 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms