Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPP55072 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPP55072 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPP55072 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPP55072 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VCPP55072 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VCPP55072 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VCPP55072 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VCPP55072 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms