Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP12AP54707 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP12AP54707 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms