Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ERG3	YLR056W	1098 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	HRT3	YLR097C	1035 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	TIF34	YMR146C	1044 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	TPP1	YMR156C	717 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	SPS4	YOR313C	1017 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	SUA7	YPR086W	1038 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	REI1	YBR267W	1182 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	MNL1	YHR204W	2391 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.26	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	snR63	snR63	255 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	PTC1	YDL006W	846 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	BUD30	YDL151C	582 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	VMA1	YDL185W	3216 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RPB7	YDR404C	516 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	BUD13	YGL174W	801 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	COX2	Q0250	756 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	PHO12	YHR215W	1404 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YKL071W	YKL071W	771 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	PHO11	YAR071W	1404 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	MRPL39	YML009C	213 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	FRM2	YCL026C-A	582 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	IME4	YGL192W	1803 nt		4.25	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	BUD8	YLR353W	1812 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	FRA2	YGL220W	363 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	PRE9	YGR135W	777 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	VPS71	YML041C	843 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	HEK2	YBL032W	1146 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RRP40	YOL142W	723 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	CMR3	YPR013C	954 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YCF1	YDR135C	4548 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RNA14	YMR061W	2034 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	SLM5	YCR024C	1479 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	GCD1	YOR260W	1737 nt		4.24	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YDL027C	YDL027C	1263 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YDL094C	YDL094C	510 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	ARF2	YDL137W	546 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	ECM34	YHL043W	513 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	TFA2	YKR062W	987 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YLR049C	YLR049C	1287 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YLR283W	YLR283W	945 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	UMP1	YBR173C	447 nt		4.23	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	PTR3	YFR029W	2037 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	TRM13	YOL125W	1431 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RAD54	YGL163C	2697 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	NTH1	YDR001C	2256 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	IRC14	YOR135C	342 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YRM1	YOR172W	2361 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	KRE29	YER038C	1395 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	MAG2	YLR427W	2013 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RIM4	YHL024W	2142 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	GPI10	YGL142C	1851 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	ATM1	YMR301C	2073 nt		4.22	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	SRS2	YJL092W	3525 nt		4.21	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	YMR221C	YMR221C	1515 nt		4.21	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.21	□□□□□ -1.73
DSL1	P53847	SDT1	YGL224C	843 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	LSB1	YGR136W	726 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	UPS2	YLR168C	693 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	NOP8	YOL144W	1455 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	TRF5	YNL299W	1929 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.21	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	STU1	YBL034C	4542 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	TYR1	YBR166C	1359 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YGR219W	YGR219W	342 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	VMA22	YHR060W	546 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	SPO20	YMR017W	1194 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	PWR1	PWR1	941 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	SHE3	YBR130C	1278 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	BUD5	YCR038C	1929 nt		4.2	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	MDL1	YLR188W	2088 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	PHO13	YDL236W	939 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FMP10	YER182W	735 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	ELF1	YKL160W	438 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	IES3	YLR052W	753 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	CPR3	YML078W	549 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	SPO19	YPL130W	672 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	TIF5	YPR041W	1218 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.19	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	KRE5	YOR336W	4098 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	NUS1	YDL193W	1128 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YDR222W	YDR222W	1248 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	AIM22	YJL046W	1230 nt		4.18	□□□□□ -1.74
DSL1	P53847	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.18	□□□□□ -1.74

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