Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LBX1P52954 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LBX1P52954 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LBX1P52954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LBX1P52954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LBX1P52954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LBX1P52954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LBX1P52954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LBX1P52954 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms