Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF143P52747 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF143P52747 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms