Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF140P52738 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms